[水资源]巴州地表水年均自产流量106亿立方米，其中塔里木河33.7亿立方米、迪那河1.3亿立方米、孔雀河3.54亿立方米、车臣河4.51亿立方米、若羌河2.2亿立方米。全州地下水天然补给量为30.41亿立方米/年，地下水开采量为21.73亿立方米/年。全州水能蕴藏量为296万千瓦。

　　[土地资源]巴州地表总面积482665平方千米。在全州总面积中，草原面积1100万公顷、林地面积5.72万公顷。2001年末，全州共有耕地20.72万公顷。

　　[动植物资源]巴州自然条件呈现多样性，动植物资源丰富。有野生动物73种，隶属6目18科，占全疆野生动物种数的56%；有鸟类264种，隶属16目24科，占全疆鸟类种数的74%；有两栖爬行类野生动物10种；有鱼类14种。巴州分布的名贵野生动物有野骆驼、大天鹅、普氏原羚、塔里木兔、马鹿、罗布泊盘羊、白尾地鸦、新疆大头鱼等。有野生植物2200多种，经济价值较高的野生植物有罗布麻、芦苇、甘草、柴草、羌活、麻黄、香蒲等20余种。

　　[矿产资源]截至2001年底，已探明矿种58种，矿产地704处，其中大中型矿床39处。矿种主要是：石油、天然气、钾盐、煤、铁、锰、铬、铜、铅、锌、岩金、沙金、磷、硭硝、石膏、玉石、石棉、蛭石、石墨、饰面大理石、水泥石灰石等。其中蛭石储量居全国之冠，占全国储量的93%；石棉、石膏、玉石、白云岩、菱镁矿、危如累卵锰和陶瓷粘土的储量居自治区首。石油、天然气、钾盐等资源量丰富。

　　[旅游资源]按照《中国旅游资源普查规范》的资源分类系统来衡量，全国68种旅游资源基本类型中，巴州拥有46种，占全国旅游资源基本类型问题的70%，占新疆旅游资源基本类型总量的85%。湖泊、大漠、草原、高山、洋峰以及众多的历史文物遗址形成了一个大的旅游资源格局。主要的旅游景点有博斯腾湖、巴音布鲁克大草原、塔克拉玛干大沙漠、阿尔金山自然保护区、铁门关、楼兰古城、锡克沁千佛洞、米兰遗址、巴仑台黄庙、满汗王府等。